Les troupes de l'HYDRA sont segmentées en division, selon leur spécialité. Les membres de ces divisions sont reconnus par un petit écusson représentant un animal :
Castor : ingénierie et construction des bases
Chameau : approvisionnement
Dragon de mer : action navale, servant le Commandant Kraken
Faucon : combat aérien
Hibou : planification et gestion
Léopard : reconnaissance
Renard : personnel diplomatique, servant l'Imperial
Rhinocéros : armement et véhicules blindés
Taupe : administration et espionnage
Tigre : assassinat et armement